lunes, 2 de agosto de 2021

25. Penetrancia, expresividad y pleiotropía | 🧬 Genética clásica | Joseleg

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Las relaciones de dominancia entre alelos para un rasgo dado pueden afectar las proporciones fenotípicas, pero las interacciones entre diferentes genes también pueden afectar el fenotipo. Tales rasgos que resultan de la interacción entre múltiples genes y su entorno se llaman rasgos complejos. Entonces, dado un rasgo específico, ¿cómo podemos saber si es complejo? Una forma de reconocer un rasgo complejo es a través de patrones de herencia inconsistentes en generaciones sucesivas. Por ejemplo, un rasgo dominante podría omitir toda una generación y aun así expresarse en la siguiente generación. ¿Cómo es esto posible? La respuesta a esta pregunta radica en los conceptos de penetrancia y expresividad (Miko, 2008b).

Penetrancia

Al estudiar las relaciones entre genotipo y fenotipo, es importante examinar la ocurrencia estadística de fenotipos en un grupo de genotipos conocidos. En otras palabras, dado un grupo de genotipos conocidos para un rasgo, ¿cuántos genotipos idénticos muestran el fenotipo relacionado? Puede que se sorprenda al saber que, para algunos rasgos, el fenotipo puede no ocurrir tan a menudo como el genotipo que debería generarlo. Por ejemplo, supongamos que todos en la población W tienen las mismas combinaciones de alelos para un determinado rasgo, pero solo el 85% de la población muestra realmente el fenotipo esperado de esas combinaciones de alelos. La proporción de genotipos que realmente muestran fenotipos esperados se llama penetrancia. Por lo tanto, en el ejemplo anterior, la penetrancia es del 85%. Este valor se calcula al observar poblaciones cuyos genotipos conocemos (Miko, 2008b), y por lo tanto en los ejercicios de lápiz y papel es un dato que viene en el enunciado o que debe obtenerse al comparar las probabilidades esperadas y experimentales.

Figura 251. La función del ADN es almacenar las instrucciones para producir proteínas activas, pero en medio de eso hay una serie de pasos conocidos como: transcripción “ADN ARNmi conocido como transcripto primario o mensajero inmaduro”; procesamiento o maduración “ARNmi ARNm”; transporte del mensajero madurado al ribosoma; transcripción “ARNm proteína inactiva”; y activación “proteína inactiva a forma activa”. En cada uno de los pasos el loci inicial puede ser bloqueado o alterado por proteínas encargadas de cada uno de los pasos, todos estos son los controles epigenéticos.

De hecho, se necesitan grandes estudios poblacionales para medir la penetrancia, y los estudios de penetrancia nos ayudan a predecir qué tan probable es que un rasgo sea evidente en aquellos que portan los alelos subyacentes. En general, cuando sabemos que el genotipo está presente pero el fenotipo no es observable, el rasgo muestra una penetrancia incompleta. Básicamente, cualquier cosa que muestre menos del 100% de penetrancia es un ejemplo de penetrancia incompleta. Por lo tanto, aunque la penetrancia de un rasgo es un valor estadísticamente calculado basado en la aparición de un fenotipo entre genotipos conocidos, la penetrancia incompleta es simplemente una descripción cualitativa de un grupo de genotipos conocidos (Miko, 2008b).

Un ejemplo específico de penetrancia incompleta es la osteogénesis imperfecta (OI) una enfermedad del desarrollo de los huesos humanos. La mayoría de las personas con esta enfermedad tienen una mutación dominante en uno de los dos genes que producen colágeno tipo 1, COL1A1 o COL1A2. El colágeno es un tejido que fortalece los huesos, los músculos y otros tejidos corporales múltiples. Las personas con OI tienen huesos débiles, color azulado en el blanco de los ojos y una variedad de afecciones que causan debilidad en sus articulaciones y dientes. Sin embargo, esta enfermedad no afecta a todos los que tienen mutaciones COLIA1 y COLIA2 de la misma manera. De hecho, algunas personas pueden portar la mutación, pero no tienen síntomas. Por lo tanto, las familias pueden, sin saberlo, transmitir la mutación de una generación a otra a través de alguien que porta la mutación, pero no expresa el fenotipo de OI (Miko, 2008b).

Tenga en cuenta que la expresión de otros genes, como los reguladores transcripcionales o translacionales, puede influir en el efecto final de un producto génico. Cualquier cosa que interfiera con la ruta de la transcripción a la activación de proteínas se conoce como un factor epigenético. De hecho, hay múltiples puntos en los que otro producto génico puede intervenir en las etapas previas a la producción de una proteína. La interferencia en estas etapas puede detener la producción por completo, crear una forma alterada de la proteína que podría no estar activa, o hacer cualquier cantidad de otras, si las cosas siempre conllevan al silenciamiento de la proteína implica una disminución de la penetrancia, pero si solo la denilita hablaremos de expresividad. Por lo tanto, la etapa final de una proteína activa refleja muchos procesos diferentes, que conducen a la secuencia de aminoácidos y a la forma definitiva de la proteína, todos los cuales pueden ser interferidos por otros genes, lo cual indica que hay que ir más allá del viejo aforismo “un gen, una proteína, un rasgo”. Además, algunos genes pueden regular hacia arriba o hacia abajo las tasas de transcripción, lo que cambia la cantidad total de proteína producida. Por lo tanto, los genes que afectan la forma final y la cantidad de expresión de otro gen pueden ser influyentes en la formación del fenotipo derivado del gen regulado.

Entonces, si existen tantos puntos de modificación posibles diferentes para un producto génico, ¿cómo podemos reducir la pregunta de qué causa la penetración incompleta? Curiosamente, algunos científicos han intentado hacer esto al observar cómo las mutaciones genéticas que causan la OI afectan a los ratones. Estos investigadores insertaron una forma mutada de COL1A1 en ratones y los criaron para que todos contengan esta mutación. Los ratones se vieron afectados de forma similar a aquellos con OI humana: muchos tenían debilidad ósea severa y múltiples fracturas óseas, incluso al nacer. De hecho, cuando los investigadores examinaron de cerca los huesos del ratón, descubrieron que el 70% de los ratones con el gen COL1A1 mutado mostraban evidencia de OI (fracturas óseas); sin embargo, el 30% restante parecía completamente normal. En estos ratones sin fenotipo OI, hubo la misma cantidad de expresión de COL1A1 que en aquellos ratones que mostraron el fenotipo. Además, los investigadores utilizaron una raza pura de ratones que tenían poca variabilidad en sus genomas, para empezar. Esto significa que el contexto genético en el que se expresó COL1A1 no varió entre los ratones estudiados. Sin embargo, a pesar del hecho de que todos los ratones tenían genomas extremadamente similares y todos expresaban la misma cantidad de COL1A1, el 30% de ellos no mostraba ningún fenotipo OI. Estos resultados continúan siendo desconcertantes. Por lo tanto, incluso las poderosas técnicas experimentales actualmente disponibles no pueden explicar la penetrancia. Las dos explicaciones más populares para la penetrancia incompleta, el fondo genético y los niveles de expresión variables, no explicaron la falta de fenotipo en el 30% de los ratones (Pereira, Halford, Sokolov, Khillan, & Prockop, 1994).

Expresividad

Individuos con el mismo genotipo también pueden mostrar diferentes grados “y cuando hablamos de grados, debemos hacer referencioa de manera inevitable a las ideas darwinistas” del mismo fenotipo. La expresividad es el grado en que la expresión del rasgo difiere entre los individuos. A diferencia de la penetrancia, la expresividad describe la variabilidad individual, no la variabilidad estadística entre una población de genotipos. Por ejemplo, las características del síndrome de Marfan varían ampliamente; algunas personas tienen solo síntomas leves, como ser altos y delgados con dedos largos y delgados, mientras que otros también experimentan complicaciones potencialmente mortales que afectan el corazón y los vasos sanguíneos. Aunque las características del síndrome de Marfan son muy variables, todas las personas con este trastorno tienen una mutación dominante en el gen que codifica la fibrilina 1, FBN1. Sin embargo, resulta que la posición de la mutación en el gen FBN1 se correlaciona con la severidad del fenotipo de Marfan. Los investigadores encontraron que una mutación en una posición de FBN1 es frecuente en familias con síntomas graves, mientras que una mutación en otra posición es frecuente en familias con síntomas menos graves. Estos hallazgos son una pista alentadora sobre cómo los defectos específicos en la proteína de la fibrilina 1 pueden explicar la expresividad variable en el síndrome de Marfan (Li et al., 2008).

Figura 252. El gato de Hemingway con polidactilia. Debido a que el gen de la polidactilia siempre causa dedos extra en los gatos, pero el número de dedos adicionales varía entre los individuos con el gen, la polidactilia se considera un ejemplo de "expresividad" variable.

Otro ejemplo de expresividad en el trabajo es la aparición de dedos extra, o polidactilia, en gatos. La presencia de dedos extra en la pata de un gato es un fenotipo que surge en grupos de gatos que se han cruzado por generaciones de manera endogámica. De hecho, hay varios grupos conocidos de estos gatos, como los de Key West Island (conocidos como "los gatos de Hemingway"), así como los que se encuentran en clusters de reproducción en el este de los EE. UU, y las costas de las Islas Británicas. El primero en informar sobre este fenómeno fue C. H. Danforth, quien estudió la herencia de la polidactilia en 55 generaciones de gatos. Observó que el fenotipo de polidactilia mostraba "buena penetrancia, pero expresión variable" porque el gen siempre causa dedos extra en la pata, pero el número de dedos adicionales varía ampliamente de un gato a otro (Li et al., 2008). A través de sus estudios de crianza, Danforth descubrió que, aunque un alelo dominante subyace a la causa de la polidactilia, el grado de polidactilia depende de la condición de los tejidos estratificados adyacentes en la extremidad en desarrollo; es decir, la expresión de los genes en los tejidos que rodean al tejido que se convertirá en el dedo del pie determina el grado de polidactilia (Li et al., 2008).

Modelo matemático

El modelo matemático en este caso se hace complejo pues debemos manejar muchas probabilidades, y dado que el símbolo de probabilidad se repite mucho, emplearemos la misma solución que se usa para la concentración molar en química, y usaremos un corchete para representar implícitamente que estamos trabajando probabilidades.

En este caso la probabilidad esperada del fenotipo dominante corregido con penetrancia [D]0,p dependerá de la probabilidad teórica de los genotipos corregida con la penetrancia [genotipo]0,p. A su vez, dicha probabilidad corregida será el producto de la probabilidad teórica tal como se obtiene de un cuadro de Punnett u otras técnicas factoriales [genotipo]0 por la probabilidad de la penetrancia [genotipo]p.

Si aplicamos lo anterior a un sistema monohíbrido de dos alelos A/a, obtendremos que:

Ejemplo. El ojo lobular un rasgo dominante con respecto al ojo silvestre. Las moscas de una población pura de Drosophila sp., con el gen de ojo lobular dominante “A” se puntúan por sus fenotipos, la presencia del gen se realizó por electroforesis de ADN, por lo que se puede correlacionar la presencia del genotipo con el fenotipo externo. Solo el 90% de las moscas de esta colonia con genotipo homocigoto dominante manifiestan el fenotipo dominante. Para los heterocigotos solo el 70% manifestaban el fenotipo dominante. Los homocigotos recesivos “aa” jamás presentan el fenotipo dominante. Determine las probabilidades de los fenotipos dominante y recesivo para un cruce de dos heterocigotos.

Hacia una mirada evolutiva sintética

La relación entre genotipo y fenotipo no es simple. Algunas veces, los alelos dominantes pueden ser silenciados por otros genes que minimizan la apariencia del fenotipo. En otros casos, la expresión génica puede modificarse de manera sutil, pero puede tener un gran impacto en el fenotipo. Las causas exactas de la penetrancia y la expresividad aún no se conocen bien. Cuanto más aprendamos sobre los mecanismos moleculares que rigen la regulación genética, más podremos formular y probar hipótesis sobre cómo surge esta variabilidad. Sin embargo, en este punto ya nos acercamos al tipo de herencia gradual que le interesaba a Darwin y Wallace, la herencia continua o gradual.

 

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